As propostas de alteração da Lei Orgânica passam pelo crivo do prefeito?

Não. Diferentemente dos projetos de lei ordinária, que precisam passar pela sanção ou veto do prefeito, as propostas de emenda à Lei Orgânica, depois de aprovadas, são promulgadas diretamente pela Mesa Diretora da Câmara Municipal.

Isso acontece porque as emendas à Lei Orgânica possuem um rito de tramitação especial, determinado pela própria Lei Orgânica, com base no que dispõe o art. 29 da Constituição Federal.