Ao final de cada ano, os participantes da etapa estadual do PJ Minas escolhem um tema de relevância social e de interesse dos jovens para ser trabalhado nas atividades de formação, reflexão e discussão, visitas técnicas, palestras de especialistas e elaboração de propostas da edição seguinte.
Desdobrado em três subtemas, o tema é o mesmo em todas as câmaras municipais que participam do projeto. O voto dos representantes das cidades na plenária final é a última etapa do processo, iniciado bem antes com os debates municipais e regionais em que são colhidas as opiniões de todos os estudantes envolvidos.